Formation IFB 2026 | Initiation au traitement des données de génomique

Formations

Date d’ouverture des dépôts

03/03/2026

Date limite des dépôts

10/05/2026

Le réseau France Bioinformatique (IFB), l'INSERM et l'INRAE organisent la session 2026 de l'école doctorale et professionnelle EB3I. Cette formation immersive est dédiée au traitement des données de variants, ChIP-Seq, Bulk RNA-Seq et Single-Cell RNA-Seq.

Contexte et objectifs

L'école EB3I propose une expérience d'apprentissage intensive pour les biologistes confrontés à l'analyse de données de séquençage à haut débit (NGS). L'objectif est de permettre aux participants d'acquérir une compréhension approfondie des concepts et de maîtriser les outils informatiques nécessaires pour interpréter leurs propres résultats de recherche.

La formation couvre un large spectre thématique :

Sessions théoriques et ateliers pratiques couvrant le traitement de données de : variants, ChIP-Seq, Bulk RNA-Seq, Single-Cell RNA-Seq
Introduction aux technologies « long reads »
Tutorat personnalisé pour aider à élaborer un plan d’analyse adapté aux propres données des participants

Environnement de travail et pédagogie

L'apprentissage repose sur une approche pratique en environnement Linux (terminal) et langage de programmation R. Bien qu'aucune connaissance préalable ne soit requise, une autoformation en ligne est préconisée en amont. Un point fort de cette école est le tutorat personnalisé : une trentaine de formateurs issus des plus grands instituts (CNRS, INRAE, Inserm, Institut Pasteur, etc.) guideront les participants dans l'élaboration du plan d'analyse de leurs propres données de recherche.

Public visé

Chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, doctorants et praticiens du secteur académique ou industriel.

Doctorants : Un certificat de présence pour 39 heures de formation est délivré.

Informations pratiques

Dates : Du dimanche 15 novembre (18h) au vendredi 20 novembre 2026 (14h).
Lieu : Hôtel de France, Roscoff (29).
Langue : Cours en français, supports en anglais.
Frais : 1000€ HT (Académiques/EPIC) | 3000€ HT (Industriels). Hébergement et restauration inclus.
Subventions : Possibilités de prise en charge pour les agents INSERM et INRAE.

Modalités de candidature

La sélection des participants (40 places disponibles) s'effectue sur dossier. Le degré de maturité du projet scientifique impliquant l'analyse de données NGS est un critère d'évaluation majeur.