École thématique - EBAII-NGS-1 : Nouvelles technologies de séquençage

Du
au
Institut Pasteur Place Georges Teissier 29680 Roscoff

L’école thématique EBAII-NGS-1 s’adresse aux biologistes impliqués dans des projets utilisant des technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS). Cette édition est consacrée aux nouvelles avancées technologiques en NGS, avec un focus particulier sur l’analyse des données. L’école proposera des ateliers pratiques accompagnés de cours théoriques, permettant aux participants de se familiariser avec les outils bioinformatiques essentiels pour interpréter les résultats issus du NGS.

Objectifs

Cette école a pour but de :

  • Introduire les concepts liés au séquençage de nouvelle génération (NGS) et aux technologies associées.

  • Permettre aux participants de manipuler les outils informatiques pour l’analyse et l’interprétation des données.

  • Offrir un tutorat personnalisé permettant aux participants de débuter l’analyse de leurs propres données ou de celles issues de plateformes.

  • Cibler particulièrement les étapes préliminaires de l’analyse des données NGS, notamment dans le cadre des technologies long reads.

Les quatre ateliers thématiques suivants seront proposés en parallèle :

  • Bulk RNA-seq

  • ChIP-seq/ATAC-seq

  • Variants génomiques/Génotypage

  • Single-cell RNA-seq

Les participants auront la possibilité de suivre l'atelier de leur choix et d'apprendre à élaborer leur plan d’analyse sous la supervision de formateurs spécialisés.

Organisation

Dates : Du 16 au 21 novembre 2025
Langue : Français
Environnement de travail : Commandes en ligne (terminal Linux), langage R

La formation alternera des sessions théoriques courtes et des ateliers pratiques. Des sessions de tutorat personnalisé seront proposées pour guider chaque participant dans la mise en œuvre de son projet d’analyse.

Pour qui ?

Cette formation est destinée aux biologistes et chercheurs travaillant avec des projets NGS. Aucune connaissance préalable des environnements Linux ou R n’est requise, mais les participants devront suivre une autoformation en ligne préalable afin de faciliter leur prise en main de ces outils. La formation approfondira progressivement l’utilisation de ces outils au fur et à mesure des sessions thématiques.

Comment s'inscrire ? 

  • Date limite de pré-inscription : 7 juin 2025

  • Sélection des participants : Juin 2025

Le nombre de places étant limité à 40 participants, les candidats seront sélectionnés sur la base des informations fournies dans le formulaire de candidature. Le degré de maturité du projet scientifique et l’implication dans l’analyse de données de séquençage seront des critères d’évaluation majeurs.

Frais de participation

  • 1000 € HT pour les académiques et les EPIC

  • 2500 € HT pour les industriels

Ces frais incluent l’hébergement et la restauration.