Ecole de bioinformatique Assemblage & Annotation AVIESAN/IFB/Inserm : Initiation au traitement des données de génomique obtenues par séquençage à haut débit
Cette édition de l’école de bioinformatique Assemblage & Annotation AVIESAN/IFB/Inserm (EBAII) se déroulera du 25 au 30 septembre 2022 à la Station biologique de Roscoff.
La formation s’adresse à des biologistes, (ingénieurs, doctorants, chercheurs, enseignants-chercheurs, praticiens…) impliqués dans des projets “Next Generation Sequencing” (NGS).
Cette édition de l’école aborde les nouveaux enjeux technologiques : elle s’articulera autour des différentes étapes qui mèneront à l’obtention d’un génome annoté à partir de données “long reads” et “hybride” : contrôle qualité des données, assemblage, scaffolding, polishing, annotation structurale et fonctionnelle.
L’école vise à introduire les concepts, à manipuler les outils informatiques et à en interpréter les résultats. Elle est basée sur une alternance de courtes sessions théoriques et d’ateliers pratiques. Les participants bénéficieront d’un tutorat personnalisé pour élaborer leur plan d’analyse, et effectuer les premières étapes de traitement de leurs propres données ou de celles de leur équipe.
Public visé :
Biologistes (ingénieurs, doctorants, chercheurs, enseignants-chercheurs, praticiens…) qui ne disposent pas des compétences bioinformatiques suffisantes. L’ensemble de la formation reposera sur l’utilisation de Galaxy.
Modalités d’inscription (limité à 40 participants) :
Le comité d’organisation sélectionne les participants sur le degré de maturité du projet scientifique impliquant l’analyse de données de séquençage.
Date limite de pré-inscription : 15 mars 2022 (sélection des participants en avril 2022)